对脑神经侵犯所引起的症状和体征，称为岩蝶综合征。当肿瘤侵犯颞骨的岩部和蝶骨进入海绵窦时，因为第VI支脑神经在海绵窦的内下部，因此第VI支脑神经常首先受到侵犯。由于鼻咽肿瘤的局部侵犯，或肿大的淋巴结压迫咽侧间隙，可引起声哑或鼻音、味觉改变的病症。
针对咽部括约肌功能不佳的情况，可能会引起吞咽困难、呕吐反射减弱或消失，及软腭上抬不对称、斜方肌和胸锁乳突肌萎缩，以及单侧舌肌萎缩和伸舌时舌偏位的发生。由于颈交感神经受侵，还会出现霍纳综合征等。
由于咽侧间隙受侵而引起的相关症状，称为腮腺后间隙综合征；其第I、W和VID对脑神经即使当肿瘤已发展到晚期，通常仍保持正常功能。诊断评估经过详细的病史问诊和理学检查后，必须进行间接和直接鼻咽镜检查。
诊断上必须仔细观察全部的鼻腔和咽部表面，以估计肿瘤的局部侵犯范围，可以在表面麻醉下，对原发肿瘤直接取活检。如果在鼻咽部看不到原发肿瘤，可以用细针对任何肿大的淋巴结进行针吸，以及对可能侵犯的鼻咽部位进行随机活检。